J'ai aussi des écarts entre le débité et la facture mais je fais + simple :
- depuis qu'il n'y a plus de tva ça simplifie bien
- j'imprime une copie d'écran de l'entête de facture Ebay sans m'intéresser au détail
- je passe le "montant total dû" (et non montant facturé) sur le compte 401105 (fournisseur Ebay)
- je le solde par le compte 622201 (commissions Ebay)
- je le règle classiquement avec mon compte paypal 517000

Une fois le montant à l'écran n'était pas celui débité (2 euros d'écart...), j'ai ajouté une remarque à la main et basta...

J'ai un papier qui dit pareil que le montant débité sur le relevé bancaire et en plus sur ce débit je ne cherche pas à récupérer de la TVA donc amha ça suffit.