C'est bon, après avoir retourné le problème sous tous les angles, j'en suis venue à bout:
pour que le compte paypal soit crédité des paiements en attente, il faut absolument que l'adresse du compte paypal corresponde à celle du compte ebay!
Mon adresse paypal était différente de celle enregistrée sur ebay, c'est tout bête...
Dans le menu Préférences de paypal il faut donc ajouter l'adresse email d'ebay.
J'espère que cela pourra vous aider.