Je confirme j'ai eu le service client Ebay et il y a un lien au fond de l'aide, qui permet de demander le remboursement du trop-payé moyennant fourniture d'un justificatif (extrait de la page):
Paiement en double de la TVA
Si la TVA vous a été facturée une seconde fois par le transporteur pour la livraison de vos biens, contactez eBay à l'aide du lien ci-dessous et fournissez-lui la preuve du double paiement. La TVA facturée par eBay sur la transaction initiale pourra alors vous être remboursée
Demander le remboursement de la TVA
Pour demander le remboursement de la TVA sur une commande finalisée, connectez-vous et chargez une preuve d'excédent de paiement.
Nom de la page de l'aide en question "Payer les taxes sur les achats effectués sur eBay". Rebrique qui va bien en bas de page.
